Ein gefährlicher Gegner Namens Black Darkness wurde befreit und droht, die Welt zu zerstören. Ink, Sumi und ihre Gefährten reisen in das magische Königreich, um Black Darkness zu bekämpfen.
時の番人であるアリスが黒い闇に連れ去られ、魔法王国にも人間界にも想像できない災いが降りかかる……いんくとすみはアリス救出に立ち上がるが、人間界で罪を償っているあーくん＆かーくんが魔法王国に戻るには“時のパレット”を使わなければならない。しかしこのパレットを開けるには、いんくとすみの魔法力をすべて使わないといけない。ということは、もう二度と魔法少女に変身できなくなっちゃうの！？
