中立コロニーヘリオポリス。ここでの地球連合軍の機動兵器開発を知ったザフト軍は、ヘリオポリスへの侵攻を開始。平和なコロニーが一瞬で戦場と化す。
The Orb Union space colony, Heliopolis, is attacked by ZAFT, despite its neutrality since the beginning of the Bloody Valentine War. Kira Yamato accidentally sees the Earth Alliance's new prototype mobile suits, which have been secretly constructed at the Heliopolis Morgenroete factory. He encounters his childhood friend, Athrun Zala, now a ZAFT soldier as one of the attackers.
Die Kolonie Heliopois wird von ZAFT-Einheiten attackiert, obwohl der Staat seit Kriegsbeginn neutral ist und nicht am aktuellen Kampfgeschehen teilgenommen hat. Der junge Coordinator Kira und seine beiden Freunde Miriallia und Tolle befinden sich zufällig in einer geheimen Station, als der Angriff beginnt. Sie sehen durch Zufall die Mobile Suit Gundams, die in diesem geheimen Stuetzpunkt hergestellt werden.
Des soldats de ZAFT s'introduisent dans la colonie d'Héliopolis afin de dérober cinq prototypes de Mobile Suit mis au point par l'Alliance Terrienne. Le jeune Kira Yamato se retrouve bien malgré lui impliqué dans le conflit.
