An EF fleet led by Orb forces heads towards to Black Sea to deal a critical blow to ZAFT. However, a third party is waiting in the wings to stop the battle.
Dans l'espace, les nombreuses attaques lancées par les forces terriennes échouent les unes après les autres aussi l'alliance se trouve dans une mauvaise passe. Elle décide de faire à nouveau appel à son allié LOGOS en la personne de Djibril qui propose d'exploiter les forces d'ORB.
C'est ainsi que la bataille entre les forces du ZAFT et celles d'ORB devient inévitable. Le Takemikazuchi lance la première attaque à laquelle le Minerva répond en envoyant ses mobile suit. Alors que le combat se poursuit, le commandant Gladys ordonne l'activation du Tannhäuser mais un invité surprise fait son entrée...
Una flotta EF guidata dalle forze di Orb si dirige verso il Mar Nero per infliggere un duro colpo a ZAFT. Tuttavia, una terza parte sta aspettando dietro le quinte per fermare la battaglia.
シンは、ステラから貰った貝殻を妹・マユの携帯と共に、大切にしていた。険悪だったアスランとの関係も、気さくなハイネが潤滑油となり、徐々に変化し始めていく。一方、ステラはシンとの記憶を除去され、シンが傷に巻いてくれたハンカチのこともすでに忘れていた。ステラたち強化人間は、戦闘に邪魔な記憶を定期的に消されていたのだ。
その頃、ユウナを指揮官とするオーブ軍の艦隊が、ネオらと合流すべくスエズへ向かっていた。大西洋連邦からの圧力に屈したオーブ議会は、派兵を承認してしまったのである。
敵の増援として現れたオーブ艦隊に、動揺するアスラン。そんな彼に、ハイネは「割り切れよ。今は戦争で、俺たちは軍人なんだからさ」と優しく声を掛ける。多少気持ちが和らいだアスランは、シンがオーブを嫌う心情をようやく理解するのだった。シンは、平和だった頃のオーブを愛していた。それゆえに、変わり果てた現在のオーブを憎んでいるのだ。
ダーダネルス海峡で、両軍はついに激突。シンとアスランが出撃し、ミネルバの陽電子砲・タンホイザーは、オーブの護衛艦群に照準を合わせるが……発射寸前に突如現れたフリーダムが、タンホイザーを貫いた。
对PLANT动武却屡遭挫折的加百列让奥布对黑海地区出兵,而尤拉也欣然答应了此事,并决定自己随奥布军队一同出动。 史黛拉的精神出现不稳定,在尼奥的安抚下才安静睡去,但在醒来后却已记不清曾经和真发生的故事。 海涅正式被配属于密涅瓦号上,平易近人的海涅很快便赢得了大家的喜爱。 虽然军队内部都对出兵抱有疑问,但由一艘航母和六艘护卫舰组成的奥布军还是迅速地到达了联合军的苏伊士基地。密涅瓦号决定在马尔马拉海到达达尼尔海峡间的区域布防。被奥布军出兵黑海的消息所震惊的不仅是阿斯兰和真,还有大天使号上的众人,以及目前是自由记者的米丽亚。在单独谈话中,海涅教导阿斯兰不要忘记自己的军人身份,在战争中滥动慈悲肯定会死的。 作为前阵的奥布军开始了攻击,密涅瓦号出动了脉动高达及救世主高达迎击。塔丽亚下令使用阳电子炮对奥布舰队进行攻击,但就在开炮的一刹那,从天而降的光束将密涅瓦号的阳电子炮击毁。发出这一攻击的,是驾驶自由高达的基拉。