Things aren’t looking well for Student Council, the members are hurt and Medaka is incapacitated. To make matters worse, a new group of 13 students have offered their help to Supervisor Naze.
“フラスコ計画”の続行を宣言した名瀬夭歌こと黒神くじら。
そこに現れためだかは、くじらと六年ぶりの再会を果たす。
真黒、くじら、めだか。三人の思いが交差する中、めだかはくじらの策略により記憶をなくしてしまう。
「ところで、ここはどこで、私は誰で、何のために生まれてきた？」
記憶を失いながらも、現状を把握しためだかは、古賀に戦いを挑むのだが？
