Ein halbes Jahr ist seit der Beendigung des Konfliktes rund um Fate und dem Beginn der innigen Freundschaft zwischen ihr und Nanoha vergangen. Um Fate ein möglichst normales Leben zu ermöglichen zieht ihre neue Adoptivmutter Lindy mit Fate und Arf auf die Erde, wo Fate nun die gleiche Klasse wie Nanoha besucht. Doch die Freude über ihre Wiedervereinigung währt nur kurz, denn schon kurz darauf werden die Wolkenritter in der Stadt gesichtet, eine Gruppe von magischen Rittern, welche dem "Buch der Finsternis" entstammen und dessen Seiten durch das Absorbieren magischer Kräfte zu füllen trachten, um so ihrem Meister zu großer Macht zu verhelfen.
Six months have passed since the events in the previous movie. Fate has returned to Uminari City with Lindy as her legal guardian and is living the life of a normal elementary schoolgirl along with Nanoha and her friends. The reunion between the two new-found friends is cut short, however, when they are assaulted by four ancient magic users who identify themselves as the Wolkenritter. As the motives behind the actions of the Wolkenritter become clear, Nanoha and Fate find themselves in a race against time to stop the reactivation of a highly dangerous artifact known as The Book of Darkness.
죽음을 부르는 마도서와 그 주인으로 선택받은 소녀. 절망의 숙명에 맞서는 두 명의 마법소녀. 맹세를 품은 기사들과 마음을 담아 하늘로 향하는 소녀들.
마음은 하나, '믿었던 인연을 지키고 싶어.'
Le second film de la franchise "Magical Girl Lyrical Nanoha" reprend à travers ce film, comme "Magical Girl Lyrical Nanoha The Movie 1st" le faisait avec la première saison, les événements de la seconde "Magical Girl Lyrical Nanoha A's". Quelques mois à peine ce sont écoulés depuis les événements de l'affaire Testarossa, Nanoha et Fate, désormais amies, travaillant toutes deux désormais pour le Bureau d'Administration de l'Espace et du Temps, se retrouvent confronté à une nouvelle menace... Cette fois-ci, c'est du Livre des Ténèbres, une puissante relique capable de capturer la puissance des magiciens et dont le réveil serait terrible dont il est question. Nanoha et Fate se lancent donc avec le Bureau dans une enquête pour empêcher ce désastre mais se heurtent violemment contre les Gardiens du Livre des Ténèbres... Les Wolkenritters...
