Die Ninja wollen herausfinden, wer in ihrem Namen die Verbrechen begeht, die die Stadt ins Chaos stürzt. Um schneller zu sein, teilen sie sich auf. Doch das war ein großer Fehler: Ronan, welcher der festen Überzeugung ist, dass die Ninja schuldig sind, fängt für den Polizeichef jeden einzelnen der Ninja ein und bringt sie hinter Gitter. Unterdessen treibt Nadakhan - der Flaschengeist - weiterhin sein Unwesen in der Stadt und kommt seinem Ziel, seine alte Mannschaft zu befreien, immer näher. Zur Unterstützung hat er dazu nämlich jetzt auch den Weltenkristall!
The Ninja must find out as much as they can about Nadakhan before he finds the Realm Crystal to save his crew, but after the Ninja are labeled enemies by the world they used to protect, our heroes find themselves hunted by their old friend, Ronan.
Nadakhan suunnittelee varastavansa maailmankristallin. Poliisi on palkannut Roninin jahtaamaan pakomatkalla olevia ninjoja.
Les ninjas sont pourchassés mais la police n'arrive pas à les capturer. Malheureusement pour eux, Ronin offre ses services et ils se retrouvent maintenant sur le chemin de la redoutable prison de Kryptarium...
Mentre Nadakhan progetta di rubare il Cristallo del reame, i ninja in fuga sono inseguiti da Ronin, assoldato dalla polizia per rintracciarli.
Terwijl Nadakhan een plan smeedt om de Realm Crystal te stelen, worden de vluchtende ninja's opgejaagd door Ronin, die door de politie is ingehuurd om hen op te sporen.
Ninjorna måste ta reda på allt vad de kan om Nadakhan innan han hittar rikets kristall och räddar sin besättning. Samtidigt blir ninjahjältarna jagade av sin gamla vän, Ronan.
Mientras Nadakhan conspira para hacerse con el Cristal del Dominio, la policía recurre a Ronin para que capture a los ninjas fugitivos.