Knapp ein Jahr nachdem Michael Nikita von der "Mind Control Process" Gehirnwäsche befreite, der von Gelman erfunden wurde und Operations und Madeline an ihr testeten, beginnt Nikita unter plötzlich auftretenden, schmerzvollen Nachwirkungen zu leiden. Sie bedrohen nicht nur Nikitas Gesundheit, sondern auch ihre Mission den Bio-Waffenexperten der Collective gefangen zu nehmen.
O'Brien deckt Nikita, denn er weiß, daß Operations nach einer Entschuldigung sucht um sie zu eliminieren. O'Brien arbeitet mit Walter zusammen, um Nikita bei der Suche nach einem Heilmittel zu helfen. Leider finden sie eines, daß Gewebeproben von Adrian erfordert - Gelman's ursprünglichem Testobjekt - Und Michael war der einzige, der Adrians Aufenthaltsort kannte.
Glücklicherweise enthält die Diskette, die Nikita in dem mysteriösen Haus entdeckte die Adresse von Adrians's letztem bekannten Standort. Sie vermutet, daß sich Michael immer noch außerhalb befindet und ihr hilft. Aber die Zeit rennt davon und wenn der Prozess nicht bald aufgehalten wird, wird Nikita sterben...
After the explosion at the house of Nikita's father, Nikita enlists Walter, and then Jason Crawford, to decript its contents. The result; the location of the convelecence home where Michael took Adrian after the "Gelman Process" mess. And this just happens to coincide with Nikita's physical deterioration because of her experience with the "Gelman Process." Has Michael or Nikita's real father given her the information she needs to beat these after effects? Or is Nikita inevitably heading to the same place Adrian ended up, namely the grave? Meanwhile, O'Brien betrays Nikita, by revealing her deteriorating health to Operations, but unsure that O'Brien will be able to resist Nikita's "charms" any more than Michael did. Operations 'shadows' O'Brien with his very own 'pit bull' operative, Golliak. And Section One continues to try and crack "The Collective."
Après une explosion à la maison du père de Nikita, celle-ci recrute Walter puis Jason Crawford pour décrypter son contenu. Résultat : le lieu d'une maison de convalescence où Michael a amené Adrian. Et cela coincide exactement avec la déterioration physique de Nikita. Est-ce que Michael ou le vrai père de Nikita lui a donné l'information dont elle a besoin pour combattre ces effets secondaires ?
Dopo essersi salvata in tempo da un’esplosione alla presunta casa di suo padre Nikita comincia a soffrire di pesanti emicranie e una serie di disturbi conseguenze del processo Gellman. Durante una missione infatti è incapace di proseguire e viene aiutata da O’Brien anche se non si capisce bene da che parte stia visto che Operations gli ordina di tenere d’occhio Nikita e riferirgli tutte le sue azioni. Ma dopo che uccide un operativo che li stava seguendo il suo apporto diventa sincero ed insieme a Walter decide di aiutare Nikita.
Выясняется, что на Никиту начинает действовать вирус, который образовался в результате "промывки мозгов" от чего умерла и Эдриан, когда Майкл привез ее, уже умирающей, в дом престарелых. Ей на помощь рвутся Вальтер и О'Брайан, которого Шеф назначил следить за Никитой, а чтобы он не пал в объятия ее чар, которым были подвержены Майкл, Вальтер и Беркофф, он приказал Голиаку следить за О'Брайаном. Но тот был застрелен им, когда он заметил, что он за ним следит. На фоне этих событий, за четыре часа, оперативники на пару с Никитой и О'Брайаном уничтожают вредоносную химическую фабрику. Вальтер, О'Брайан и Никита, пытаясь спасти ей жизнь приезжают на кладбище, где похоронена Эдриан, чтобы взять образцы ДНК, но находят там коммуникатор PF3, который Никита берет с собой. На задании ей становиться плохо и тут появляется голос из коммуникатора, который помогает ей установить взрывчатку. Ей кажется, что это Майкл, но "голос" ничего не отвечает на это и требует, чтобы она делала только то, что он ей говорит. Вальтер делает Никите укол от вируса с расчетом, что через пару дней ей это поможет.
Walter y O´Brien buscan la cura para ayudar a Nikita, cuando ésta empieza a sufrir los efectos a largo plazo del proceso de control de la mente de Gelman.