DN-Amy gelingt es, den sogenannten Genom-Sequenzer aus einem wissenschaftlichen Labor zu entwenden. Mit Hilfe dieses Gerätes lassen sich kleine puschlige Wesen "herstellen". Dr. Drakken sieht in dieser wissenschaftlichen Erfindung die Möglichkeit, Mutanten herzustellen. Mit denen will er die Weltherrschaft an sich reißen.
It's super villains in love when Drakken hits on DNAmy for her mutation skills. Only Kim and her genius science fair partner can stop Middleton from becoming extinct at the claws of a Barney-gone-baddie.
Dr. Drakkens försök att skapa en armé av genetiskt förbättrade supersoldater misslyckas eftersom han inte riktigt behärskar tekniken. Men genom att samarbeta med genetikern Amy ”DNAmy” Hall tror Drakken att han ska kunna lösa problemen. I skolan i Middleton handlar det också om samarbete när eleverna ska arbeta parvis med olika vetenskapsprojekt. Ron Stoppable ska arbeta tillsammans med Monique, och Kim får det unga geniet Justine Flanner som partner. Personkemin i grupperna stämmer inte alls, men så anfalls staden av Drakkens och DNAmys jättelika dinosaurie och då kommer saken i ett annat läge.
Drakken se apaixona por DNAmy.