Yoshimori and Tokine find out that the transfer student, Gen Shishio, is a member of Masamori's Night Troop and was in fact sent by Masamori to protect the Kekkaishi of Karasumori. Meanwhile gramps is doing some research on the "skin" that the Ayakashi dropped.
Shishio Gen fait son apparition dans l'école de nos 2 héros. Celui-ci ferait parti du Yagyou et aurait été envoyé dans le but d'aider nos 2 kekkaishis à défendre la terre Karasumori. Cependant Yoshimori n'a pas l'air heureux de devoir faire équipe avec ce mystérieux personnage.
Pendant ce temps, Shishio va voir Tokiko dans sa demeure; et tente d'aller discuter avec le Grand-père de Yoshimori, mais ce-dernier semble absent. En effet, Shigemori se trouve chez un de ses amis, un certain Matsudo Heisuke, pour lui demander d'analyser le reste de peau humaine utilisée par les Ayakashis.
A son retour de l'école, une fois arrivé chez lui, Yoshimori tombe nez à nez avec Shishio, ce qui est loin de le ravir. C'est alors que Shigemori fait son retour dans la demeure et ne semble pas d'accord au sujet de la collaboration avec l'Urakai.
Le soir, Tokine et Yoshimori se retrouvent sur le domaine Karasumori pour accomplir leur travail. Alors qu'ils font face à un ayakashi plutôt agile, la bête se fait exterminer pas une mystérieuse aura démoniaque appartenant à... Shishio. Celui-ci ne veut pas travailler avec des kekkaishi qu'il qualifie de faibles.
Puis deux nouveaux personnages font leur apparition au bout de leur dimension : La Princesse Hime, (chef de la mystérieuse organisation) et Byaku (commandant). Celui-ci révèle ses intentions de s'emparer de Karasumori.
裏会からの書状を手に雪村家と墨村家を訪ねた志々尾だが、帰宅した繁守から裏会が出てきたことを快く思っていないと言われ、正守の真意を測りかねる。一方、良守も兄とつながる志々尾に反発するが…。