Kamen Rider Chronicle has been reset thanks to Masamune's special ability! Thanks to his Bugster infection, his hidden power has awakened, and the game is reset to the moment before Emu received the Hyper Muteki Gashat! Finally, with Parado having already been defeated, Graphite is the only game character left in order to clear Kamen Rider Chronicle! Brave and Snipe both challenge Graphite with a burning fighting spirit. Meanwhile, Emu believes that Graphite infected with Gamedeus' virus may be the only one strong enough to defeat Cronus. However, Graphite refuses to cooperate with the Riders…
『仮面ライダークロニクル』は正宗の能力によってリセットされてしまった。永夢と同じように人類で初めてのバグスターウイルスに感染した“オリジナル”である正宗の「ハイパームテキさえなければ」という思いが覚醒し、ハイパームテキガシャットが存在する直前の時点まで、ゲームをリセットさせてしまったのだ。一方、パラドがエグゼイド側についたことで、クロニクルで倒すべき敵はグラファイトただ一人になっていた。グラファイトをライバル視し、闘志を燃やすブレイブとスナイプ。だが一方で、クロノスに対抗する手段であるムテキの力を失ったエグゼイドは、ゲムデウスの力をもつグラファイトこそが唯一クロノス攻略の鍵だと考える。ところがグラファイトはライダーたちへの協力を拒んで―――。