Für das Wohl der Menschen möchte Iron Man den Satelliten „Howard“ aktivieren. Doch plötzlich wird der Start des Satelliten durch einen Anschlag des Bösewichts Ezekiel und dessen Terrorgruppe unterbrochen. Außer Iron Man überlebt niemand diesen Angriff. Ezekiel lässt es so aussehen, als ob Iron Man den Terroranschlag verübt habe. Nun muss der Superheld seine Unschuld beweisen, doch das ist gar nicht so einfach mit den Feinden dicht auf den Fersen.
The film explores a confrontation between Iron Man and the villainous Ezekiel Stane, who develops new bio-technology that seemingly outclasses the Iron Man armor. After Stane unleashes a terrorist attack and sets Tony Stark up to take the fall, Iron Man must evade S.H.I.E.L.D.'s man hunt and find a way to clear his name.