Als vor einiger Zeit vor der Küste von Hawaii ein russisches Spionage-U-Boot strandete, war es von der Navy nur teilweise geborgen worden. Nun, ein Jahr später, werden Teile der elektronischen Ausrüstung an Land gespült. Als zur gleichen Zeit der junge David Hammond von Gangstern entführt wird, glaubt McGarrett an einen Zusammenhang: Davids Schwester, Dr. Margaret Hammond, ist Ozeanografin, und es sieht alles danach aus, als werde die Wissenschaftlerin erpresst.
While searching for parts from a sunken Soviet submarine, McGarrett become suspicious about the particular parts that are being recovered.