Delphin wird von den Rufen einer nahe gelegenen Delphinschule angelockt und verschwindet. Doch Porter Ricks und seine Kinder dem Tier folgen, stellen sie fest, dass die Laute, die Flipper von ihnen weggelockt haben, künstlich erzeugt werden. Der Forscher Dr. Peter Kellwin will Flipper als Versuchstier verwenden und hat ihn so von seiner 'Familie' wegzulocken versucht.
Flipper, being a pack animal by instinct, is attracted by the sound of a school of dolphins and nothing Porter, Sandy or Bud can do will bring him back.