Haruko und Naoto wollen gemeinsam verschwinden. Doch als die Stadt unter Beschuss steht, beschließt Naota zu kämpfen.
Ever since Naota's Medical Mechanica came out of his head and was destroyed, it has been looming over the factory, in the form of a giant hand, causing mist to enshroud the entire city. To make matters worse, Haruko and Canti are on the run from Amarao, who attempts to find the Terminal Core before they do. Naota once again runs into Amarao who offers some strange advice. Things soon go insane as Haruko is preparing for the final battle, in which Naota is expected to unknowingly play the lead role. Though in a city as normal as Mabase, it's really nothing new to Naota; or is it?
Depuis que Haruko et Kanchi ont disparu suite à leur victoire sur le monstre, Naota a retrouvé sa vie morne et sans histoires et commence à s'ennuyer ferme.
C'est alors que Haruko réapparait et elle propose à Naota de partir avec elle.
De son côté, Mamimi a retrouvé l'unité centrale du robot de la Medical Mechanica et en a fait son animal de compagnie...
謎のロボットの暴動のおかげで、疎瀬にも不穏な空気が漂っていた。暗い終末感の中でもナオ太たちは普通の生活を送るが、行方をくらませていたハル子が戻ってきた時、固まっていたナオ太の心は崩れていく。ハイスピードで事態は進行し、ハル子の秘密も明らかになり、そして、街に王と名のつくスゴイやつが降りてきた。
Desde que la Mecánica Médica de Naota salió de su cabeza y fue destruida, se cernía sobre la fábrica, en forma de una mano gigante, causando que la niebla cubriera toda la ciudad. Para empeorar las cosas, Haruko y Canti están huyendo de Amarao, que intenta encontrar el Terminal Core antes de hacerlo. Naota una vez más se encuentra con Amarao, quien le ofrece algunos consejos extraños. Las cosas pronto se vuelven locas mientras Haruko se está preparando para la batalla final, en la que se espera que Naota, sin saberlo, juegue el papel principal. Aunque en una ciudad tan normal como Mabase, en realidad no es nada nuevo para Naota; ¿O es eso?