Der geschrumpfte Shinichi macht sich auf den Weg nach Hause. Vor dem Haus kracht Professor Agasa mit einer neuen Erfindung durch die Mauer. Nach längerem Hin und Her gelingt es Shinichi, sich zu erkennen zu geben. Er schmiedet mit Professor Agasa einen Plan. Als Ran auftaucht, gibt Shinichi sich als kleiner Verwandter von Professor Agasa aus und behauptet, Conan Edogawa zu heißen. Professor Agasa bittet Ran, Conan mit zu sich nach Hause zu nehmen und eine Weile bei sich zu behalten. Als Ran mit Conan bei ihrem Vater Kogoro Mori, dem erfolglosen Privatdetektiv eintrifft, hat dieser gerade einen neuen Fall übernommen. Die Tochter eines reichen Industriellen, Herrn Tani, ist entführt worden.
Shin'ichi tries to come to terms with his new size and convinces Hiroshi of who he is and assumes the identity of Conan Edogawa. He moves in with his girlfriend Ran and her father Kogorou. Conan helps to find a kidnapped daughter of a wealthy businessman.
Shinichi Kudô prend le pseudonyme de Conan Edogawa avant d'aller s'installer chez Ran Môri dont le père est détective privé afin de retrouver ses agresseurs.
Shinichi si accorge che il suo corpo è regredito sino a farlo sembrare un bambino delle elementari e decide di chiedere aiuto al dottor Agasa, un inventore che abita nella casa accanto alla sua. Questi gli consiglia di non rivelare a nessuno la sua vera identità perché metterebbe in pericolo chiunque sia a conoscenza del suo segreto.
黒服の男に殴られ意識を失った新一が目覚めると、飲まされた毒薬のせいで身体が小学生くらいまでに縮んでしまっていた。新一は小学生の江戸川コナンと名乗り、黒服の男たちの情報を得るために私立探偵の父を持つ蘭の家に居候することに。すると金持ちの娘が黒ずくめの男たちに誘拐されたという話が入り…。
Después de cambiar su nombre por el de "Conan Edogawa", Shinichi va a vivir con su amiga Ran y el detective Kogoro Mouri, para intentar así averiguar algo sobre los hombres de negro y sobre el veneno que le encogió. Ayuda a Kogoro a resolver el caso del secuestro de la hija de un hombre rico.
【主线剧情】趁警察不注意工藤逃到阿笠博士那里寻求帮助,这时担心工藤的小兰找也找到这里,为保护小兰安全,工藤隐瞒身份并在情急之下取名江户川柯南,阿笠博士将柯南托付给小兰照顾,回家后他们碰到了急匆匆出门办案的毛利小五郎,听说有黑衣人,柯南也跟着一起去。原来是董事长女儿谷晶子被绑架,在管家承认了自己是犯人且没有同伙后,却再次有人打来威胁电话……
La droga no ha matat en Shinichi: el seu cos ha encongit fins obtenir l'aparença d'un nen en edat escolar, sense afectar al seu sistema nerviós i el coneixement acumulat fins aquell moment. En Shinichi s'allunya del lloc i fuig a casa del doctor Agasa. Aquest li aconsella no revelar la seva veritable identitat, ja que, si els homes de negre descobreixen que la droga no el va matar, sens dubte tornarien a cercar-lo. La Ran, preocupada pel seu amic, va a casa de Shinichi, que, per ocultar la seva veritable identitat, es posa un parell d'ulleres i li diu que el seu nom de Conan Edogawa. Seguint el consell del doctor Agasa, en Conan va a viure amb la Ran i el seu pare, el detectiu privat Kogoro Mouri.