The Meisterguild sent genius clocksmith Marie Bell Breguet to investigate the anomaly at the Kyoto Core Tower. While there, however, she notices that the army seems to be up to something. Meanwhile, RyuZU arrives at Naoto's school as a transfer student. The entire school is up in arms because the loser Naoto is with a girl as beautiful as RyuZU...
Naoto a perdu son appartement mais a gagné un automate féminin encore bien mystérieux. Tout en allant d’hôtel en hôtel avec elle, Naoto continue sa vie normale entre les cours et le shopping. Il ignore encore que pendant ce temps, Marie et la guilde Meister font tout ce qu’ils peuvent pour sauver la ville de la purge planifiée par l’armée.
La aparición de RyuZU ha supuesto un gran cambio en la vida de Naoto. Por otra parte, Marie está intentando resolver un problema gravísimo para evitar que se haga una purga y mueran 20 millones de personas.
“1级技师行会”的天才技师玛丽·蓓儿·布列格为了调查京都大支柱的异常而被派遣,然而却察觉到了军队可疑的动作。另一方面,琉紫作为转学生来到了在直人的高中。对于不起眼的直人与美少女琉紫的组合全校发生了大骚动…!?