Dalam perjalanan untuk mendapatkan maklumat tentang Panglima Pyrapi, BoBoiBoy dan rakan-rakan menerima isyarat kecemasan dari kilang robot NuBot. Di sana, BoBoiBoy, Gopal, Qually dan Ochobot berdepan dengan musuh baharu yang tak disangka-sangka yang memaksa BoBoiBoy menggunakan kuasa fusion baharu, BoBoiBoy Gentar!