Profesör Barış Öncü, bir banka önünde kimliği belirsiz bir genç tarafından kurşunlanarak öldürülür. Behzat Ç. cinayetin siyasi boyutu olduğuna inanır. Barış Hoca tanınmış bir akademisyendir; Azınlıklar ve Ermeni meselesiyle ilgili çalışmaları olmuştur. 301'den yargılanmıştır. Milliyetçi kesimlerden tehditler aldığı bilinmektedir. Görgü tanıkları, şüpheli şahsın beyaz bir bere taktığını ve cinayeti işledikten sonra taksiye binerek olay yerinden uzaklaştığını ifade ederler. Behzat Ç. ve ekibi Beyaz Bereli şahsın peşine düşerler.
Olayı aydınlatmaya çalışan Behzat Ç., zanlıyı yakalama aşamasında birtakım engellerle karşılaşır. Ancak esas mücadeleyi, çocuk yaştaki zanlının yakalanmasının ardından, suikastın gerçek sorumlularını bulmaya çalışırken yaşayacaktır.
Öte yandan rüşvet meselesinin peşini bırakmayan Şevket, çevresini kullanarak Behzat Ç.'ye komplo kuran kişinin kimliğine ulaşmıştır. Behzat Ç. kendisine rüşvet teklif eden adamla yüzleşecek ve olayın arkasındaki kişiyi öğrenecektir.
Türkiyedeki azınlıkların sorunları üzerine çalışmalar yapan bir profesörün öldürülmesi uzerine, cinayetin politik gerekçeli olduğuna dair yorumlar yapılır.