神様を信じない高校生『上終瓜生』。
身寄りがなく養護施設で育った瓜生だが、ある日里親候補が見つかる。
京都大学医学部を目指す瓜生は、これで落ち着いて勉強ができると喜ぶが、引き取り先はなんと神社だった。
しかもそこには『甘神夜重』『甘神夕奈』『甘神朝姫』という自分と同年代で、個性的だが可愛らしい巫女の三姉妹も暮らしていた。
瓜生は突然始まった巫女三姉妹たちとの共同生活に振り回されることになる。
A young man begins a new life at Amagami shrine, and meets the three sisters who live there.
Uryu chega em sua nova casa e conhece as três irmãs Amagami, mas logo ocorrem desentendimentos, principalmente com a irmã do meio, Yuna.
Pour poursuivre ses études, Uryû part vivre dans un sanctuaire où logent trois prêtresses, toutes sœurs. Le hic, c’est qu’Uryû n’est pas très croyant et plutôt terre à terre, ce qui va entraîner quelques situations compliquées.
Uryu es un joven huérfano al que el sacerdote de un templo invita a vivir con él. Aunque él solo quiere pasar el día entre sus libros para poder ir a la Universidad de Kyoto a estudiar medicina, descubre que el templo viven tres hermanas que tal vez le compliquen un poco la vida.
Uryu, aspirante studente della facoltà di medicina di Kyoto, si trasferisce presso il santuario Amagami su richiesta del prete a capo. Lì incontra le sorelle Yae, Yuna e Asahi, tre miko devote in totale antitesi con la sua ideologia atea.
