二十年前，小兒外科專科實習醫生況叢昕與許甘楓，參與醫學院教授鍾懷霜當主刀的嶄新手術。病童林美詩因失血過多喪命，甘楓懷疑手術過程有失誤，叢昕拒絕作證，二人反目。事隔多年，叢昕成為安妮醫院的顧問醫生。院長梁鼎君與叢昕亦師亦友，二人冀盼能一起籌建兒科中心。甘楓為了西北醫院病童莫啟健，往找叢昕幫忙進行聯合手術。甘楓、叢昕聯手做手術，麻醉科醫生的失誤險令手術無法進行，心胸肺外科副顧問醫生章以芯及時出現……
周振堯接任院長，並挑選麥海琪升任外科主管，叢昕的研究項目亦被煞停。西北醫院肝移植配額被取消，甘楓備受同事指責。以芯發現病童翁巧喬患上心臟惡性血管肉瘤，巧喬父母不忍讓女兒知悉真相。叢昕知道甘楓工作不如意，提議海琪邀請甘楓加盟安妮醫院。巧喬因未能出院影響合奏練習，與同學鬧翻；以芯更覺應讓她知悉病情，故向叢昕、甘楓求助。甘楓斥叢昕刻意炒作啟健換肝事件，害他被迫離開西北醫院。
連卓盈、游芝樺等專科實習醫生，以及專科醫生文柏熙到兒科病房開展工作。叢昕為病人施手術，手術因出血問題延長。振堯指派海琪接收私症，振堯為免得失富商，下令動用緊急手術室。此時，病童田思濠傷口破裂並急需動手術，但緊急手術室被佔用，柏熙不知所措，甘楓趕至協助……甘楓責罵柏熙不懂靈活變通，柏熙大受打擊。海琪未能實踐承諾，甘楓憤然辭職。巧喬猜出自己身患絕症，並與好友和好。叢昕百感交集，向甘楓與以芯說出宏願……
甘楓重遇前女友Betsy，其言行令人側目。以芯於叢昕、甘楓協助下順利為巧喬切除血管肉瘤，以芯希望甘楓留在安妮，甘楓卻開出無理條件。柏熙的能力備受質疑，甘楓給予機會讓他擔任主刀。叢昕繼續完成與鼎君合撰的論文，獲海琪相助。柏熙夥拍卓盈進行膽囊切除手術，發生意外……叢昕的論文獲國際醫學期刊發表，第一作者竟是振堯……Betsy情緒失控道出為人父母的壓力與辛酸，以芯有所感慨，及後突然不適暈倒……
振堯提議與叢昕合作建立兒科中心，叢昕拒絕。患有家族性澱粉樣多發性神經病變的李沛星被送院，叢昕建議為他同時更換三個器官，遭振堯反對。海琪向沛星父母講解病情，叢昕突然向他們提出可做三重器官移植手術，海琪大感不滿！甘楓覺得叢昕做法不妥，以芯認為他對叢昕充滿偏見。叢昕向倫理評審會提出以研究名義進行三重器官移植手術，眾委員反對。沛星病情急轉直下……
以芯、叢昕、甘楓合力完成手術，懷霜到來恭賀眾人，甘楓對懷霜充滿敵視。懷霜表明日後可以多與叢昕合作，並推薦叢昕加入倫理評審會，甘楓不滿叢昕靠攏懷霜。陳珮如欲把一對子女帶到醫院交給甘楓照顧，但甘楓正進行手術，珮如竟將子女臨時交托給以芯。颱風將至，海琪忙於安排應對措施，叢昕欲勸她學習放開。甘楓禁不住又與叢昕吵起來，此時，醫院突然停電……少婦羅麗娜帶着半歲女兒睿睿來看急症，遇上狂風暴雨……
海琪統籌各項應急措施，振堯竟主動協助。以芯發現睿睿有嚴重心臟問題，需進行緊急手術。十號風球下，卓盈的父親連城武到急症室求醫。海琪被玻璃所傷，叢昕為她處理傷口，卻雙雙被困研究室。護士伍勵寶得知有病童確診患有肺腫瘤，情況危急。水淹電機房，後備電源即告損毀，醫院全面大停電，柏熙、芝樺摸黑觸診尋找病患。以芯為睿睿做手術，副手戴日進突然昏倒，甘楓趕來幫忙，但睿睿的心臟仍無法正常運作……
以芯發現甘楓透過交友軟件結識異性，熱心幫他挑選對象。柏熙遭無禮挑剔的大叔煩擾糾纏，其後才得知他的身分……甘楓接收患有罕見病的盧可琳，其母劉依莉曾是叢昕的病人。海琪、以芯、甘楓即興結伴觀星，與叢昕不期而遇，叢昕決定成立一個手術精英團隊。社工向懷霜商借往日其夫文志圖為兒童院拍照的底片，勾起懷霜與柏熙的心結。經診斷，可琳的腎臟長出2.5厘米的腫瘤，依莉哀求甘楓與柏熙改寫報告。
甘楓縱拒絕依莉的請求，但仍想替可琳爭取資助。社交平台爆出振堯公器私用的醜聞，叢昕、海琪等看見振堯被傳媒追訪的狼狽相，都覺大快人心。病童否認沒遵守禁食規定，卓盈決定如常進行手術；病童卻於手術中出現食物倒流，幸得上司郭葆晶出手，病童才得以保命。勵寶為柏熙送上便當，柏熙不為所動。振堯在研討會力指叢昕安排肺腫瘤病童轉院並不妥當，叢昕以銳利詞鋒反駁。依莉探望可琳，依莉的腫瘤突然破裂，需立即進行緊急手術……
甘楓安慰可琳，決心為她爭取資助，怎料本來順利的申請，竟突然遇上阻撓。叢昕與艱難團隊商量外科助手人選誰屬，眾人對於選柏熙或是鄧偉聰意見各異。海琪的丈夫蘇炳良是植物人，炳良的姐姐希望接炳良回加拿大，海琪內心萬般不願，卻不敢拒絕。柏熙見卓盈因失誤受罰，對她伸出援手。叢昕要求柏熙與偉聰想出病童誤吞鋼珠的解決方案，偉聰猜想出柏熙的方法，捷足先登……在會議上，振堯阻撓兒科中心的發展，懷霜的言論令形勢大轉……
叢昕接手醫學院轉介的個案，半歲大的蔡思瀚先天腸道閉鎖，手術後病情未有改善，其主診醫生是振堯的太太林明珠。芝樺接收十六歲女病人徐佳雪，檢查證實佳雪懷孕，但同時驗出她的卵巢有腫瘤，佳雪的父親為保女兒性命決定放棄胎兒。電視台到醫院拍攝兒科專題特輯，以芯受訪，道出當無國界醫生時的一段往事。炳良的舊同學Sandra前來探望他，海琪直覺她跟炳良有不尋常關係，向叢昕吐露心事……芝樺忙了一整天，突然在梯間昏倒。
卓盈發現芝樺倒臥梯間，芝樺經檢查後，需要進行緊急手術……柏熙發現思瀚的病因，明珠不肯承認有錯，振堯亦力挺其妻，拒讓柏熙為思瀚動手術。叢昕以情況危急為藉口，着柏熙為思瀚做緊急手術；振堯於受訪途中，衝進手術室阻止。手術前夕，佳雪哀求海琪替她留住胎兒。海琪大感為難，因佳雪之父已簽手術同意書。佳雪不欲令父親失望，隨即收回請求；佳雪卻於手術後昏迷……
懷霜轉介印度皇室後裔Mike給叢昕，懷霜指如成功治好他，興建兒科中心的計劃可暢通無阻。佳雪之父終明白女兒的心意，向海琪表達謝意。芝樺思量應否繼續當醫生，向以芯提到小時候曾遇過一位仁義細心的急症室醫生，以芯希望找出這名醫生鼓勵芝樺。柏熙與一眾專科實習生相約宵夜，途中遇上懷霜……甘楓開始追求以芯，但以芯絲毫不察。叢昕以振堯大鬧手術室的短片作要脅，要他同意興建兒科中心；振堯及後卻向叢昕還擊……
芝樺辭掉工作，眾人難掩不捨。會議上，振堯提出將空置的地皮改為興建腸胃科中心，叢昕竟沒有反對。醫院為兒科病人舉辦狗醫生活動，Mike與病童白俊彥結成朋友；二人病情日趨惡化，以芯診斷後指他們均急需肺部移植。以芯不小心扭傷腳，甘楓見狀大為緊張，更藉機向以芯表白……海琪安排炳良轉院，忍不住伏在叢昕懷裡痛哭。以芯收到通知，將有一對屍肺送到安妮醫院，同時亦意味着要從俊彥與Mike中作出取捨……
以芯想出一個冒險方法同時拯救Mike與俊彥，懷霜不欲節外生枝，從中阻撓；叢昕無懼開罪懷霜，成功將以芯的計劃推上手術台。芝樺在醫院重遇同儕們，頓覺滿心失落與不捨。甘楓鼓勵芝樺，芝樺終重新掁作。海琪發現振堯暗中蒐集她在佳雪手術中違規的證據，得知叢昕為了顧全她而放棄打擊振堯，決定回應叢昕的感情。卓盈迎來惡耗，柏熙無從安慰。Mike與俊彥的手術成功，引起外界迴響，此時Mike卻傷口大出血……
艱難團隊大受打擊，振堯直指以芯的失誤導致手術失敗。柏熙等懷疑病童何小玉患上蜂窩性組織炎，但亦擔憂是更嚴重的壞死性筋膜炎，惟無法即時給予小玉的母親一個肯定答案。及後，小玉情況急轉直下……懷霜告誡叢昕，他要在友情與兒科中心之間二擇其一。甘楓等翻查以芯施手術的閉路電視片段，終發現手術失敗的原因……甘楓與以芯欲找出證據，但證據已被人悄悄取走！海琪擔心其他病人有術後併發症危機，吩咐眾醫生為病人作緊急檢查。
海琪堅持為病人作緊急檢查，此舉觸怒振堯。消失的證據竟突然出現在以芯辦公室，以芯等為免受到振堯從中阻撓，決定暗中調查。杜霏晨和杜霏雨是一對雙胞胎姊妹，甘楓懷疑霏雨可能患有罕見遺傳病威爾遜症，謹慎起見，霏晨亦要接受檢查。以芯猜測收到證據的因由，相約叢昕、甘楓與海琪晚餐商討此事，四人離開餐廳時遇上賊人，證據亦被搶去……柏熙得知先前腸扭轉的病人個案原來是懷霜暗中擺佈，柏熙頓感羞辱，與懷霜大吵。
甘楓猜到遇劫一事別有內情，叢昕知道無法再隱瞞，以芯對叢昕失望透頂，與他反目。柏熙情緒越墮困境，手術期間頻頻出現手震徵狀……興建兒科中心的計劃正式通過，懷霜再次轉介個案給叢昕，但叢昕私症配額已滿，懷霜欲以行政手段提升醫生的私症時數。芝樺轉到內科開展專科實習生涯。海琪不想叢昕受懷霜制肘，藉機向記者澄清安妮醫院增加私症時數只是傳聞。叢昕見海琪公然與懷霜對抗，有所反思……
葆晶、日進為女兒問題大吵，葆晶暫住以芯家。叢昕為海琪慶祝生日，海琪感動，叢昕正想表白，海琪接到炳良最新病情的通知……卓盈察覺柏熙情緒有異，柏熙斷然否認。新聞間接證明以芯的清白，懷霜將叢昕從倫理評審會拉下馬，二人正式割裂。患有先天氣管狹窄的白思雅又再入院，叢昕與海琪想起當初級醫生的日子。芝樺找以芯幫忙，甘楓誤會以芯想撮合自己與芝樺。柏熙情緒不穩，突然向勵寶大發脾氣。
葆晶看見病童因為父母關係惡劣而產生痛症，從中得到覺悟。病童林劍培懷疑染上第五病，情況及後突然轉差，有感染風險的以芯為他做急救。以芯等候病毒檢測結果，甘楓花盡心思打氣，發現以芯原來已對自己動心。思雅得知需要再次做手術更換氣管支架，驚恐發作；叢昕與海琪竭力為她尋找新出路。海琪決定離婚，炳良竟翻臉指海琪同樣是背叛者。振堯靠攏懷霜，遵她建議強制將已成年的兒科病人轉往成人科，振堯更強行接手思雅的手術。
柏熙受藥物影響日深，情緒失控下與懷霜發生激烈衝突，更出現嚴重的副作用……以芯確診感染病毒，及後需要接受緊急手術……懷霜的坐骨神經痛日益嚴重，但她對柏熙的情況放心不下，堅拒做手術。振堯堅持親自處理思雅的手術，一眾醫生都質疑振堯的能力，暗替思雅擔憂。叢昕決定故技重施，與海琪密謀將思雅的手術當作緊急個案處理，提早做手術。卓盈再發現柏熙企圖濫藥，勸阻時被他弄傷。
海琪、叢昕為如何處理柏熙偷藥之事大吵一場，海琪認定叢昕不擇手段。叢昕向振堯請求讓他出任思雅手術的副刀。柏熙坦承自己因情緒病而濫藥，主動要求休假，振堯以此事要脅懷霜。卓盈欣慰柏熙終願意面對問題，二人和好。振堯查出甘楓私自更改醫療報告，召開會議追責；振堯追究知情不報的海琪與葆晶。明珠帶同幾個從私家醫院跳槽過來的醫生入主安妮；以芯回醫院復工，才發現小兒外科發生巨變……
以芯得知甘楓更改醫療報告，大感錯愕，向甘楓問個究竟。卓盈收到美詩的舊照，查證後得知懷霜竟是美詩手術的主刀醫生。海琪、葆晶認定叢昕暗中告密，將他視作陌路人。振堯與明珠提出更換醫療器材供應商，叢昕沉着應對。柏熙與卓盈發現美詩的手術報告內容不合常理，柏熙追查，懷疑另有內情……安妮聯同醫學院與麾濤合作，開展突破性的3D打印研究計劃。叢昕發現懷霜與麾濤之間藏着千絲萬縷的關係，以芯亦收到一個震撼的消息……
少女程念璇因盲腸炎入院，其父程志斌極其緊張。甘楓向明珠要求加入3D打印研究小組。眾人偶而得悉當日告密的不是叢昕，始知一直錯怪叢昕。思雅因支架變形再度入院，叢昕驚悉支架竟是麾濤出品；振堯為免事情鬧大，拒絕再讓叢昕參與手術。麾濤欲注資兒科中心，以芯使計找出麾濤老員工，老員工和盤托出……叢昕離開醫院之際，看到志斌突然抽搐痙攣，命懸一線。
(大結局)明珠的下屬張梓立私下找上甘楓，希望甘楓接手為霏雨做手術，然而甘楓亦對霏雨的手術毫無把握。志斌遷怒叢昕，投訴他專業失德。叢昕接受委員會聆訊，有委員挑剔他用字前言不對後語。叢昕獨自來到美詩墓前，不料遇上懷霜……甘楓逐一追查3D打印研究報告提及的外國醫療機構，揭發重大秘密。卓盈發現兒童院郭院長留給她的一封信，信中道出一直隱藏着的真相！懷霜自告奮勇為霏雨做手術，再次與叢昕、甘楓步進手術室……