All of a sudden, communication with Satellite Zea has been cut off! An investigation further reveals that someone is intentionally jamming the frequencies! Izu summons the Doctor Humagear Bot, who is responsible for Humagear systems manufacturing and development, to the Hiden Intelligence lab to diagnose the issue. Furthermore, they start an investigation into Horobi's sudden disappearance from his containment within the A.I.M.S. facility! "I didn't create him to be a terrorist..." Bot's words reveal that he created Horobi, the Humagear who would become the archetype for MestubouJinrai.net, as he unravels the history behind the Zero-One system! Meanwhile, a mysterious Kamen Rider stands on the roof of Hiden Intelligence...
突如、衛星ゼアとの交信が途絶えた。調査の結果、何者かが意図的に通信を妨害していることが分かる。イズは、飛電インテリジェンスのラボにヒューマギアの開発と製造を担当する博士ヒューマギアのボットを召喚して、原因の究明を始める。そこに、A.I.M.S.から脱走した滅の捜査に諫が駆けつける。
「テロリストにするためにあいつらを作ったわけじゃない」
そのボットの言葉で、彼こそが滅亡迅雷ネットの原型となった滅たちヒューマギアを作ったことが判明し、博士はゼロワンに関する歴史を紐解いていくのだった。
一方そのころ、飛電インテリジェンスの屋上には、謎の仮面ライダーが佇んでいて――。