Hayato finds himself in the cockpit of the transformed E5 Hayabusa Shinkalion and squares off against a monstrous mechanized foe. At the same time, his father and the rest of the Ultra Evolution Institute wrestle with the moral implications of forcing a child to pilot a weapon of war.
『シンカリオン E5はやぶさ』を操縦し、見事に敵を撃破したハヤト。
車掌ロボのシャショットは、誰も動かせなかった『シンカリオン E5はやぶさ』を操ることができた運転士であるハヤトのことを「相棒」と呼んで大歓迎する。
しかし、まだ小学生のハヤトを危険な戦いに巻き込むことについて父・ホクトが苦しんでいることを知ってしまったハヤトは、もうシンカリオンには乗らないつもりでいた。
そんなときに、またしても巨大怪物体が現れる……。
研究所高層企圖順手推舟讓隼人成為E5駕駛員，出水表示反對，認為隼人仍是小孩，而且更是北斗的兒子，隼人在門外聽到後對駕駛E5一事產生疑慮。車長寶去到學校尋找隼人，但隼人拒絕再次坐上E5。
Hayato quien dirigió "Shinkalion E5 Hayabusa" y derrotó al enemigo brillantemente. El conductor de Robo's Shashot da la bienvenida a Hayato, el conductor que fue capaz de controlar el "Shinkalion E5 Hayabusa" que nadie podía mover, como un "compañero". Sin embargo, Hayato, que sabía que su padre, Hokuto, todavía estaba sufriendo por involucrar a Hayato en la escuela primaria en una batalla peligrosa, ya no tenía la intención de montar en Shinkalion. En ese momento, aparece de nuevo un enorme monstruo ...
