Cesar está em seu primeiro dia de trabalho como conselheiro tutelar e logo de início vai à cracolândia com Sereno resgatar uma menor de idade usuária de crack que está prestes a dar a luz. Após encontrarem a menina e a levarem para o hospital, eles recebem a denúncia que uma mãe adotiva está maltratando a filha que adotara. O problema é que esta mãe adotiva é médica do juiz Carvalho Brito, o responsável pela vara da infância e adolescência. Como se não bastassem os desafios que eles têm que enfrentar no ambiente de trabalho, ambos estão com sérios problemas pessoais: Sereno não tem tempo para ficar com filho e não aceita a separação da esposa e Cesar encontra uma figura que o assombrou durante a infância, seu antigo molestador.
Sereno e Cesar tentam ajudar uma mãe a conseguir uma vaga numa escola pública para seu filho, mas o que seria uma tarefa simples torna-se um caso complicado quando eles descobrem que esta mãe está sendo perseguida por seu marido, um policial violento. Enquanto isso, eles precisam ir a uma comunidade averiguar a denúncia de uma mãe que mantêm uma das filhas em cárcere privado. Em meio a todos os desafios da rotina de trabalho, Sereno se esquece de levar o material de escola que seu filho precisava para uma aula de ciência, o que abala a relação entre eles. Já César, decidi seguir seu antigo molestador para ver se ele continua na ativa e descobre que ele está trabalhando como corretor de imóveis.
Um caso chocante é denunciado por um hospital particular: uma criança recém-nascida fora espancada. A princípio, a mãe do bebê leva a culpa pelo ato, mas Sereno e Cesar descobrem que o pai da criança mantêm todos dominados por medo de seu comportamento violento. Agora, eles terão que correr contra o tempo para evitar que a criança sofra mais maus tratos. Enquanto isso, Sereno e Cesar vão averiguar a denúncia de que um jovem atleta, estimulado pelo próprio pai, está colocando a vida em risco para participar de uma competição esportiva. O problema é que o jovem está fazendo todo o possível para acobertar seu pai, mas isso pode lhe custar a própria vida...
Sereno tenta reconquistar a ex-mulher, sem sucesso, e ainda a envolve em seu trabalho, ao pedir que tome conta de uma criança. Cesar reencontra uma ex-namorada que sabe tudo sobre os abusos que sofreu na infância e confessa a ela que está perseguindo seu antigo molestador. No trabalho, as coisas também não andam bem para os dois conselheiros. O juiz Carvalho Brito determina que eles acompanhem uma ação de remoção da cracolândia para garantir que os menores de idade usuários sejam acolhidos. Mas a experiência de Sereno lhe diz que a falta de estrutura da ação é um convite à tragédia e, infelizmente, é isso que acontece após um policial ter o braço cortado por um usuário que se nega a acompanhá-lo. A operação vira um completo caos e Cesar e Sereno tentam ajudar o maior número de jovens possível. Além disso, um caso alarmante chega ao Conselho expondo uma sequencia de violências contra uma menina cujas evidencias indicam abusos por parte de seus familiares.
Em um caso inusitado, a filha menor de idade denuncia a própria mãe. Mas ao contrário do que se poderia imaginar, o problema não é que a adolescente seja espancada ou algo do tipo, mas sua mãe é uma acumuladora que guarda todo tipo de lixo dentro de casa. Desesperada, a menina procura ajuda do Conselho Tutelar e Cesar e Sereno a atendem prontamente. Mas o que ela não esperava é que seria mandada para um abrigo, já que sua mãe não tem condições de cuidar dela e não tem mais nenhum parente. Enquanto isso, uma vereadora entrega ao Conselho uma criança que achou dentro de uma caçamba de lixo. Eles conseguem localizar a mãe da criança e descobrem que ela tem mais três filhos e é uma usuária de crack inveterada. Agora, Cesar e Sereno terão que acolher todos os filhos da mãe usuária e convencê-la a se internar para tratamento.
Começa no exato momento onde terminou no quinto episódio da primeira temporada. Este episódio se inicia com César pretendendo atacar Murilo com uma pedra, mas logo vê que este trabalha ajudando crianças carentes. César começa a se questionar. Sereno e Brito trocam figurinhas sobre suas infâncias humildes, enquanto o promotor André, um filho de classe média, se sente deslocado. Jorjão se muda com a família para uma cidade do interior do Rio de Janeiro para levar uma vida mais tranquila. Lídia está infeliz com sua vida e, após chorar no banheiro, sofre assédio sexual vindo de um estranho no Conselho Tutelar. Mais tarde ela e Estér discutem suas posições no Conselho Tutelar. Gabriel, um garoto de 10 anos, deixa um bilhete no Conselho Tutelar, avisando que vai se matar. Ninguém sabe onde o menino está. César e Sereno travam uma verdadeira luta contra o tempo para salvá-lo. Eles o encontram entre a vida e a morte no ferro velho cujo dono é seu pai, que não quer assumi-lo como filho. Lurdes, uma menina que teve suas mãos queimadas pela mãe, Jandira, após roubar uma bala de uma loja, é mandada para morar com o pai, porém, sua madrasta, acaba colocando-a na rua por tomar o achocolatado que não era seu. Lurdes é mandada para o abrigo, mas continua a visitar a mãe, pois tem saudades. Sereno tentar ajudar, mas nada consegue fazer. Os conselheiros recebem a notícia de que Jorjão e outros dois conselheiros foram assassinados enquanto resgatavam uma criança. Sereno fica devastado e vai visitar Flávia e Fábio, mas lá acaba tendo uma discussão com sua ex-mulher. Após a briga com Sereno, Flávia decide tomar o controle de sua vida.
Em meio ao clima de velório, um novo motorista chega ao Conselho Tutelar: Edésio, 55, pai de muitos filhos e inúmeros netos, que ama sua família. Sereno está arrasado com a morte de Jorjão e seus problemas de saúde vêm à tona. César procura por terapia para tratar seu trauma de infância e Rosângela admira o esforço. Brito e Lídia discutem sobre os hábitos de Brito. Mas a vida no Conselho Tutelar não para. César e Sereno, ao investigarem uma denúncia, descobrem um recém-nascido em um apartamento. Eles o recolhem e no hospital descobrem que o menino está sofrendo de subnutrição. A mãe, Silmara, é contactada e diz ter deixado a criança sobre os cuidados da babá, que sumiu por completo. Após uma investigação do estado psiquiátrico de Silmara, Éster confirma que ela é esquizofrênica e que a tal babá nunca existiu. Eles conseguem recolher a criança e colocá-la sob a guarda da avó Elizabeth. Silmara é encaminhada para tratamento. Dora e Nilo são um casal de classe alta beirando os 65 anos que querem adotar Daiane, mas a pequena quer ficar com os pais da família acolhedora, Glória e Itamar. Itamar tenta ter a guarda de Daiane, mas Brito diz não ser possível. Glória fica desolada, mas Itamar tem um plano. Sereno prepara tudo para a transferência de Daiane para a família de Dora e Nilo, mas Glória e a menina não estão no ponto de encontro. Sereno e Edésio vão atrás do casal e descobrem que fugiram com Daiane e outras crianças. Severo os vê fugir, mas decide não fazer nada, pois ali há um amor verdadeiro.
Um bebê é encontrado por Salsicha na Cracolândia. Há boatos de que a criança é de Colega, uma usuária de crack. Sereno e César levam o bebê para o hospital. No hospital, o bebê é diagnosticado com abstinência de crack e Rosangela avisa os conselheiros que Bené, 7 anos, e Maicon, 15, vieram procurar tratamento para Bené, que teve um corte profundo no pé. Cesar e Sereno se aproximam, Maicon foge, mas Bené é acolhido pelhos conselheiros. No Conselho Tutelar, Robson chega com Joana, vulgo “Colega”. Ele explica a situação e fica responsável pela guarda de seu filho enquanto Colega vai para a reabilitação. O que ninguém sabe é que Robson não é o pai de criança, mas um intermediário que irá vender o bebê de Colega. Tentando dar um novo rumo à sua vida, Flávia vai à uma entrevista de emprego. Apesar de não conseguir trabalho, ela está animada com sua busca.
Alice, 15, e Iuri, 7, estão órfãos e são encaminhados pera o abrigo. César e Lidia começam a procurar uma família adotiva para os irmãos. A primeira família gosta muito de Iuri, mas ficam ressabiados com Alice por conta de sua aparência bruta. Alice decide fugis do abrigo, para que seu irmão tenha mais chance de ser adotado. Em outro caso, Amilcar, 9, e Ernesto, 13, são filhos de Jair, um pai alcoólatra. que coloca seus filhos em situações de risco quase que diariamente. Alice foge com Sinésio, um dos meninos do abrigo, mas se arrepende e volta. Lídia a deixa toda limpa e arrumada e o segundo casal que aparece realmente se apaixona pelos dois. André briga com Sereno por conta do atraso dos relatórios. Sereno evita uma discussão e pega André desprevenido. Após mais uma situação de risco, Jair decide parar de beber. Ele e seus filhos limpam a casa e retiram todas as garrafas que encontram. Sereno recebe uma oferta tentadora para trabalhar numa fundação de proteção à criança. O salário é o dobro e ele teria horas mais tranquilas e melhor infra-estrutura. Ele recusa, mas Oscar, o homem que lhe ofereceu o emprego, pede para Sereno pensar no assunto.
Galega, 35, é uma promotora de turismo sexual na comunidade onde mora. No momento, ela está fazendo um leilão para 3 gringos. Esse leilão consiste na venda de uma menina de 11 anos, Josi. No Conselho Tutelar os conselheiros precisam lidar com a logística de levar 80 famílias que foram removidas de um prédio invadido para os abrigos lotados. Peixoto, que cuida de um dos abrigos, se desdobra para manter a ordem em seu local de trabalho, mas é impossível. Nereide, uma das desabrigadas que está no abrigo cuida de seu filho Hélio, 6, um menino franzino que está muito doente. Nereide briga com Micão que, para se vingar, esconde um cachimbo de crack entre os pertences de Nereide e conta para Peixoto. Peixoto expulsa Nereide do abrigo e Hélio fica sozinho. Tamara, uma menina da idade de Josi é vendida por seu avô Juca para Galega. Seu destino será o mesmo de Josi? Brito e André começam a armar um plano para apressar a aposentadoria do desembargador Tavares.